生物發酵是指人為地創造一個適宜微生物（納豆芽孢桿菌和酵母菌）生長繁殖的條件，如水分（濕度）、氧氣、營養、碳氮比例、ph值、溫度等，激活休眠中的微生物，使其得到大量增殖，釋放出生物熱能，使墊料的溫度高達65℃~76℃，從而有效地殺滅病原微生物（如大多數病毒和多數未形成芽孢的細菌）和寄生蟲蟲卵等的一個生物培養過程。

（一）干原料的鋪墊攤開

各取稻殼、鋸末10%備用。其余稻殼和鋸末倒入墊料場內，在上面均勻撒上米糠、微生物菌劑混合物及生豬糞，用鏟車等機械或人工充分混合攪拌均勻。

說明：夏季制作墊料可不使用生豬糞，但當增加優質米糠用量。

第一層鋪稻殼，按設定好的稻殼高度將稻殼鋪平；第二層將鋸末鋪在稻殼上面，按設定的高度鋪平；第三層是將制備好的“酵母糠”混合物均勻地鋪撒在鋸末上面。

二、墊料的混合方法

1、第一次墊料混合

將鋪好的墊料加水混合均勻，含水量達45%~50%，如果有結塊的稻殼或鋸末應拍散，大于雞蛋的木屑應去掉，以防傷害豬體。

2、第二次濕墊料混合

將第一次混合好的墊料確認含水量在45%左右（手捏緊松開后，墊料不結團，手掌上有一點點水跡即可），然后再次均勻翻動一遍。

3、一次墊料堆積發酵

將第二次混合好的墊料堆成梯形堆，高度不得低于1.5米，每堆墊料體積不少于10立方米。墊料堆盡可能集中，減少外表面積和著地面積。原因是表層及著地20~30厘米厚的墊料溫度較低，不能發酵。

三、覆袋保溫保濕和升溫

在墊料堆積后，晝夜環境溫度小于25℃時，應當考慮遮蓋保溫。著地和頂部10厘米不需要遮蓋，以便空氣進出。如果晝夜環境最高溫度小于0℃時，應當考慮在墊料中塞入適當的開水瓶升溫。