煙草爛根，是煙草黑脛病造成的。特別是遇到陰雨連綿季節，煙田積水，更有利此病的傳播流行。防治黑脛病、防止煙草爛根的方法主要有：

一、選用抗病品種

目前曬煙抗病品種不多，可以到其他地方或者到煙草所換種解決。烤煙品種中如“大平板”、“歪把子”等，是抗黑脛病的良種。

二、栽培防病

煙草在高溫多雨季節最易感染黑脛病，在栽培時要辟開高溫多雨的季節。黑脛病菌在土壤中可存活3～5年，一般可實行3年輪作（即3年栽一次煙）。但不宜與馬鈴薯，辣椒，番茄等有黑脛病的寄主換茬。前作以小麥、玉米、水稻，高梁、山芋等為宜。還可起壟栽培（要求壟高一尺），防止煙田積水，造成不利于病菌生存蔓延的環境條件。發現病株及時拔除，并在病株穴中撒上石灰消毒，同時將病株帶出田外深埋或燒毀，還要注意使用不帶病菌的肥料。

三、藥劑防治

用15克／升乙磷鋁藥液在煙草移栽時澆灌根部，或用2000-3000倍的乙磷鋁藥液早期莖部噴霧。也可用95%敵克松每畝7兩，對干土30-40斤拌勻，于移栽和培土時撒在煙株周圍，然后蓋上土。發病初期，可用500倍敵克松溶液噴灑莖部。