基質透氣性好、保水性強，在蔬菜育苗中應用最為廣泛。但是，基質育苗中也存在一些問題，實踐中發現部分農民使用基質育的甜椒苗葉片發黃、生長不健壯，據分析，這是因苗期缺肥導致的。

有關研究表明，單位質量基質中所含有的營養量雖然不少，但育苗穴盤容積較小，所能提供的營養也就有限，最多為蔬菜幼苗提供35-40天的營養。時間再長，基質中的營養就會表現供應不足，秧苗出現脫肥現象。

冬春季節育苗時間較長，大多在40天以上，使得秧苗后期非常容易出現脫肥。上面的例子中發黃的甜椒苗多是由于換茬、整地不及時，在穴盤中育苗時間較長，沒有及時定植，也沒有為秧苗及時補肥，秧苗脫肥造成的。

再者由于棚內溫度較高，育苗基質干燥較快，農民為避免幼苗缺水，就需要經常給幼苗澆水，有的為減少澆水次數，還經常蘸盤，這使得基質中的營養物質隨水流失較多，也是造成幼苗后期營養供應不足的原因之一。

那如何避免這種現象的發生呢？首先要保證秧苗及時定植。苗子生長期間，要提前進行整地、施肥、起壟等準備工作，提倡小苗定植。甜椒育苗如果不能及時定植，就應在育苗30天后及時通過澆水補肥，補肥時可用激抗菌968苗期沖施肥，每5千克澆施1000株甜椒苗，也可每1000株甜椒苗施用芳潤（復合肥）(15:30:15)2千克。