五、出菌管理
菌袋經過逾20 d發菌培養，此時觀察到菌袋料面出現黃豆大菌蕾時，把菌袋擺放到出菇棚內開始進入出菌期管理，此時應從如下方面加強管理：
一是菌袋開口。將原來封口的棉塞蓋去掉，以增加通氣量，促進原基生長。
二是調整溫度。菌袋開口后，溫度要調至14～20 ℃。
三是增加菌棚濕度。當菌袋開口后，需要向菌棚空間、地面噴水，使菌棚相對濕度達到85%～90%，保持菌袋料面濕潤，保證原基形成，子實體正常生長發育。
四是適當加強通風管理。當菌袋開口后，注意適當加強菌棚通風換氣，保持菇棚空氣新鮮。應先噴水后通風，保證菌棚內空氣的相對濕度在85%～90%。
五是保持一定散射光照。猴頭菇子實體生長發育過程中，需要200～400 lx光照。
六、畸形猴頭菇防治
畸形猴頭菇，影響其商品價值，必須盡力防治。常見的畸形類型有珊瑚叢集型、光禿型和色澤異常型等。主要是在栽培過程中，由于管理不當所致。若生長中濕度大，通氣差，二氧化碳濃度超過0.1%時，就會刺激子實體基部產生分枝，形成珊瑚狀，致使不能形成球狀子實體；若溫度高于25 ℃以上，加上空氣濕度低，會出現不長刺的光禿子實體；若溫度低于14 ℃時，子實體即開始變紅，并隨溫度下降而加深。
防治方法：當出現珊瑚狀子實體時，應加強通風透氣，促進子實體健壯生長。產生光禿型子實體時，要加強水分管理，向空間噴霧狀水或地面灑水，以降溫補水。當子實體出現紅色時，加強溫度管理。此外，若因菌種傳代次數較多，種性退化而產生畸形猴頭菇時，應提純復壯，培育優良菌種。若因感染雜菌造成子實體變黃，則應及時連同培養基一并挖除。
七、采收與再培養
猴頭菇一般從原基形成到采收需10～15 d。子實體成熟的標志為：菇體色白，表面出現菌刺，菌刺長至1 cm左右，尚無大量孢子彈射即可采收。
猴頭采收后，清理菌袋菇根和老菌皮，停水5~7 d，扎緊袋口，繼續培養10 d左右即可形成第2批菇。一般管理好可采收2~3批菇，生物轉化率達90%~115%。
