目前發酵床雞舍主要用于飼養肉雞，能夠做比較的是近幾年最常用的兩種飼養方式，即薄墊料養雞法和網上養雞法。下面就發酵床與這兩種養雞模式做具體的對比分析。
一、發酵床養雞法與薄墊料養雞法對比
雖然發酵床養雞法和較早使用的鋪設墊料養雞做法接近，但兩者卻存在本質的區別：
1、兩者墊料的厚度不同
發酵床養雞的墊料較厚，要求達到40厘米左右；而墊料養雞的墊料不厚，遠低于發酵床養雞的墊料的厚度。
2、兩者墊料的作用不同
墊料養雞中墊料較薄，其作用只是吸附雞糞和改善地面的堅硬、冰涼等條件，不具有發酵功能，不能解決糞的出路問題。
發酵床墊料具有特殊的發酵功能，發酵能徹底分解雞糞，發酵產生熱量。
3、兩者產生的效果不同
發酵床辯明雞雞舍內幾乎沒有臭氣，熱量又把雞糞中的水分熬騰到空氣中、墊料基本保持干爽。而傳統墊料養雞的墊料比較濕，雞舍內臭氣較多。
4、兩者墊料投入資金不同
薄墊料養雞法雖然首次鋪設墊料的投入較小、但鋪一次墊料(約10厘米)只能用一個批次的肉雞，而且出欄時要人工清理出老墊料、重新鋪設新墊料。
發酵床養雞一次鋪設墊料的投入較大，但可以用3年以上時間，養雞15批次以上，平均每個批次消耗墊料3厘米，并且不需要清理和重新鋪設墊料(以上比較以飼養速生白羽肉雞為例)。
二、發酵床養雞法與網上平養法、籠養法對比
網上平養法是指肉仔雞養在特制的網床上，網床由床架網及圍網構成。
籠養法是指肉仔雞從出殼一直到出欄都在籠內飼養。它的最大優勢在于飼養密度高，雞舍利用率高，便于飼養管理中的機械化、自動化操作。
與薄墊料養雞法相比，在網上平養和籠養法的優點是地面干凈，雞群與糞便接觸少，減少腸道細菌感染和球蟲病的發生。在管理方便程度、勞動強度方面，干撒式發酵床養雞法與網上平養法、籠養法基本相同。
發酵床養雞法節省了部分供暖，這一點是網上平養法與籠養法都無法相比的。在設施投資方面，干撒式發酵床養雞法與網上平養法單位面積成本接近，而籠養法的投入要相對高很多。
另外，由于雞的胸部與網面的摩擦，網上平養法和籠養法都會出現明顯的胸囊腫病，而且籠養法還會造成雞的胸骨彎曲和軟腿病等。
盡管籠養法的最大好處是單位雞舍面積的飼養密度高得多，但總的比較，籠養法不如干撒式發酵床養雞法與網上平養法綜合效益合算。
