雙孢菇栽培的品種較多，各地科研部門根據各地的氣候特點和原料條件，相繼選育了適合各地栽培的高產優質品種，在生產上推廣應用。根據菌株在培養基上性狀的不同，主要分為以下四種類型：

①氣生型菌株

菌絲潔白，生長旺盛，尖端直立，密度均勻，基內菌絲少，產量高。

②貼生型、匍匐型菌株

菌絲灰白色，平伏較纖細，有束狀菌絲，基內菌絲多，菇體質量好。

③半氣生型菌株

菌絲潔白，菌絲短，基內菌絲數多，菌絲在培養基上的生長狀態介于氣生型菌株和貼生型菌株之間。

目前生產上應用的大多數菌株都屬于此類。如西北地區推廣的雙7、雙13等，品種表現菌絲長勢旺，吃料快，爬土能力強，子實體多單生，出菇均勻，商品性好，產量高，抗病性強，適應性廣，適合西北日光溫室栽培和高海拔冷涼地區高溫反季節栽培。

④雜交型菌株

菌絲銀白色，生長旺盛，生長快，菌被少，適應性強，兼有氣生型菌株和貼生型、匍匐型菌株的優點，產量較氣生型菌株高，質量較貼生型、匍匐型菌株好。

如全國普遍種植的as2796，該菌株菇體潔白，菇形圓整，肉質致密，子實體大小均勻，菌柄粗短，抗逆性強，高產。