2、日糧抗原過敏

胃腸黏膜中存在大量的淋巴組織，通過體液和(或)細胞免疫對抗進入胃腸道的抗原物質。

仔豬在采食飼料時，飼料中的抗原物質，包括無害的蛋白質通常可激發系統的免疫反應，在獲得免疫耐受之前，通常要經歷一段過敏時期，即飼料抗原引發仔豬發生細胞介導的超敏反應(遲發性超敏反應)，導致小腸損傷。主要表現為小腸絨毛萎縮、隱窩增生，進而引起功能變化而腹瀉。

此外，由于腸道組織的損傷，病原微生物可乘虛而入，加劇腹瀉病程。斷奶仔豬在進食固體飼料或變換飼料后，一般3－5天出現腹瀉，在無病原微生物的參與下，一個星期左右病情得以緩解。

3、營養因子缺乏

仔豬缺乏維生素(如葉酸、煙酸、泛酸)、礦物質或其它必需的營養物質(如微量元素鋅、硒、鐵、銅)，導致抵抗力降低而出現下痢。病仔豬排淡黃色、白色、灰綠色糨糊狀或水樣惡臭稀糞。

4、應激因素

仔豬由于自身免疫系統、消化系統及其酶系統尚未發育健全，對各種應激因素如斷奶后母仔分離、食物變化、伙伴變化、環境及其溫度、濕度的變化等非常敏感，產生一系列應激反應，最終導致采食量下降、消化不良而腹瀉。病仔豬排水樣或鴨糞樣稀糞。

5、哺乳母豬換料或患病

哺乳期間的仔豬主要通過母乳獲得營養，哺乳母豬換料和患病會直接影響乳汁的成分和品質，從而影響仔豬健康。