辣椒播種前或定植前施入田間的肥料為基肥。辣椒施用基肥，要選擇合適的肥料種類、合理施肥量、施肥時機以及施肥方法，以確保辣椒生長初期有足夠的養分供應，為后續的生長打下堅實的基礎。

辣椒基肥應以有機肥為主，混拌適量的化肥，可以選用植物殘體或土雜肥等有機肥和礦質磷肥、草木灰等作基肥。施用過程中要注意以下問題：

(1)施肥時機的選擇

在辣椒移栽前進行基肥的施用，確保土壤中有足夠的養分供辣椒生長初期使用。基肥的70%應在整地前撒施，剩余的40%在定植時溝施。

(2)要防止造成肥料濃度障礙

如果用過量的化肥作基肥，可能造成局部以外的肥料高濃度障礙。有機肥為緩效肥，緩沖性大，即使大量施用，也很少發生濃度障礙，因此蔬菜基肥施用總量不足時，只能通過增加有機肥的數量來滿足。

(3)基肥中的氮素化肥少用硝態和銨態氮化肥

硝態氮化肥施入土壤不易被土壤吸附，易灌溉淋失，故不宜大量作基肥。銨態氮肥施得太多，會發生嚴重的生長障礙，出現葉色黃化或萎縮現象，故不宜大量作基肥，因此，應該用有機氮肥。

(4)磷肥應全部作基肥

辣椒需要磷肥的時期是在生育初期，如果苗期磷肥不足，即使后期追施大量的磷肥，產量還會降低，所以磷肥一般全作基肥。

(5)施肥要準確合理

不同的地質、苗情、季節，施肥種類，施肥方法要有所不同。基肥的施用量應根據土壤肥力條件和辣椒產量目標來確定。

一般而言，畝產5000公斤的情況下，建議施用腐熟有機肥5000～8000公斤，并摻入適量的無機肥料如過磷酸鈣和硫酸鉀。