薏苡為一年生粗壯草本,須根黃白色,海綿質,直徑約3毫米。稈直立叢生,高1-2米,具10多節,節多分枝,葉鞘短于其節間,無毛,葉舌干膜質,長約1毫米,葉片扁平寬大,開展,長10-40厘米,寬1.5-3厘米,基部圓形或近心形,中脈粗厚,在下面隆起,邊緣粗糙,通常無毛。
薏苡的總狀花序腋生成束,長4-10厘米,直立或下垂,具長梗。
薏苡的雌小穗位于花序之下部,外面包以骨質念珠狀之總苞,總苞卵圓形,長7-10毫米,直徑6-8毫米,琺瑯質,堅硬,有光澤,第一穎卵圓形,頂端漸尖呈喙狀,具10余脈,包圍著第二穎及第一外稃,第二外稃短于穎,具3脈,第二內稃較小,雄蕊常退化,雌蕊具細長之柱頭,從總苞之頂端伸出,穎果小,含淀粉少,常不飽滿。
薏苡的雄小穗2-3對,著生于總狀花序上部,長1-2厘米,無柄雄小穗長6-7毫米,第一穎草質,邊緣內折成脊,具有不等寬之翼,頂端鈍,具多數脈,第二穎舟形,外稃與內稃膜質,第一及第二小花常具雄蕊3枚,花藥桔黃色,長4-5毫米,有柄雄小穗與無柄者相似,或較小而呈不同程度的退化。