木瓜褐腐病

木瓜褐腐病和蘋果的花腐病極其類似，從花蕾、幼葉至成果均可為害，嚴重時幼果全部發病爛掉，造成絕收。

該病的發生與環境溫濕度密切相關，當低溫來臨時，常伴隨雨雪出現，木瓜生長發育受阻，抵抗力下降，給病菌的侵入造成有利條件，該病從病菌侵入到癥狀出現有7-10天潛伏期，因此往往被人們忽視，延誤防治的最佳時期。

木瓜銹病

主要侵染成熟葉片，葉片染病后，喪失功能提前脫落。銹病發生在果枝、果柄處可造成落果，銹病引起的直接落果約5%。

早期落葉病

早期落葉病造成葉片過早枯落，樹勢嚴重衰退，花器質量差，花而不實。樹勢弱則感病亦重，造成惡性循環，重病樹很少掛住果，產量極低，而且“三年兩不收”。

對以上三種病害可進行綜合防治，主要有以下措施：

一是冬季清園消毒

將木瓜園內的雜草、落葉清除，結合修剪剪除木瓜樹上的枯枝、病枝一并清除銷毀，然后噴灑石硫合劑消毒。

二是藥劑防治

于花前、坐果后及果實膨大期進行噴霧，用多菌靈可濕性粉劑或70%甲基托布津可濕性粉劑800倍加15%三唑酮可濕性粉劑500倍液，可有效防治褐腐病、銹病和炭疽病。

在6月底、7月中分別用50%多菌靈可濕性粉劑或70%甲基硫菌靈可濕性粉劑噴霧二次，可有效防治斑點落葉病。

此外，80%代森鋅可濕性粉劑、80%代森錳鋅可濕性粉劑、25%本醚甲環唑微乳劑、50%嘧菌酯水分散粒劑等對木瓜褐腐病、炭疽病均有防治效果，可與50%多菌靈可濕性粉劑、70%甲基硫菌靈可濕性粉劑交替使用。

另外，早春（花前）噴施保護型調節劑可增加木瓜對褐腐病的抵抗力。